1.微生物肥料分泌的代謝產物具有抗旱作用，但旱情嚴重的土壤，會影響微生物的生長繁殖，微生物肥料適合的土壤含水量為50%—70%。

2.微生物肥料作土壤基施或種肥用好于莖葉噴施。

3.微生物肥料最適施用時間是清晨和傍晚或無雨陰天，這樣可以避免陽光中的紫外線將肥料中的微生物殺死。

4.微生物菌劑配上農家肥，與化肥減少一半相比，畝最少可節省20—40元，施用微生物菌劑有防蟲抗病的功能，要算減少農藥投入量和增產，效益更加可觀。

5.微生物肥料施入到土壤后，有一個適應、生長、供養、繁殖過程，一般15天后就可以發揮作用，見到成效，而且長期、均衡地供給莊稼營養。

6.微生物肥料含有活性生物體，對土壤條件要求相對較嚴格，使用時一定注意有效施用條件，嚴格按照產品使用說明操作，否則難以獲得良好的使用效果。

7.微生物肥料不宜久放，拆包后要及時施用。施用前應存放在陰涼干燥處，避免受熱、受潮及陽光直接照射。

8.微生物肥料可單獨施用，但不能代替化肥，其與其他肥料混合使用效果更好。