新建有機肥廠需要注意以下問題：

1、有機肥原料進廠通道應獨立且偏僻，與企業主通道分開。有機肥原料有可能是糞便，在運輸過程中有可能會有掉漏。

2、員工生活區須與發酵車間和原料庫分開。

3、辦公區應盡量遠離發酵車間和原料庫，且辦公區應在廠區的上風位置。

4、原料庫-發酵車間-半成品車間-加工車間-成品庫，應具有連續性，間隔不遠。

5、有機肥生產主要有兩個環節，一是發酵處理環節，二是粉碎造粒包裝環節。

6、在原料發酵處理環節所占用場地相對較大，可以根據已購土地面積和投資資金來靈活選擇發酵方式和發酵設備。